Salut,
Au vu des 2 "plats" coté gauche et droit de ton trou, ça ressemble a un jeu à l'inversion ; si ta pièce est dans le même sens sur l'image que sur la machine alors tu dois avoir un gros jeu en X qui se manifeste quand l'axe change de sens.
les accélérations à 1000, voir 2000, ça me semble plus qu'optimiste !!! c'est très brutal, essais de te limiter autour de 4 à 500mm/s² si tu ne veux pas risquer la perte de pas (voir même une usure prématurée du matos !)
++
David